MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 chromosome chromosome 1

Total Repeats: 16441

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_011312	CAT	2	6	744283	744288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3502	NC_011312	AAAG	2	8	744291	744298	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_011312	CTT	2	6	744609	744614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3504	NC_011312	G	6	6	744626	744631	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_011312	TAGG	2	8	744643	744650	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_011312	GTC	2	6	744661	744666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_011312	A	6	6	744800	744805	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_011312	ACCCC	2	10	744810	744819	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
3509	NC_011312	A	6	6	744838	744843	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_011312	GA	3	6	744855	744860	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_011312	TGA	2	6	744924	744929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_011312	CT	3	6	744936	744941	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3513	NC_011312	TTA	2	6	744982	744987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_011312	CGG	2	6	745108	745113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3515	NC_011312	ATG	2	6	745184	745189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_011312	TGAAAT	2	12	745217	745228	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_011312	TAC	2	6	745282	745287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3518	NC_011312	ACC	2	6	745379	745384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3519	NC_011312	TGG	2	6	745439	745444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_011312	TCC	2	6	745465	745470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3521	NC_011312	GGA	2	6	745482	745487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_011312	GGT	2	6	745602	745607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_011312	CGG	2	6	745689	745694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3524	NC_011312	TCA	2	6	745717	745722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3525	NC_011312	CGT	2	6	745797	745802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3526	NC_011312	GAT	2	6	745837	745842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_011312	GCT	2	6	745851	745856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3528	NC_011312	GTT	2	6	745900	745905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_011312	GTT	2	6	746019	746024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_011312	ACG	2	6	746032	746037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3531	NC_011312	GT	3	6	746050	746055	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_011312	TGC	2	6	746059	746064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3533	NC_011312	ACA	2	6	746111	746116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3534	NC_011312	T	6	6	746340	746345	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_011312	AGA	2	6	746346	746351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_011312	TTTA	2	8	746381	746388	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_011312	TTAT	2	8	746497	746504	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_011312	AGC	2	6	746557	746562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3539	NC_011312	TC	3	6	746594	746599	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3540	NC_011312	A	6	6	746615	746620	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_011312	GT	3	6	746701	746706	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_011312	TC	3	6	746719	746724	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3543	NC_011312	AAG	2	6	746741	746746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_011312	CTCC	2	8	746804	746811	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3545	NC_011312	TATG	2	8	746822	746829	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_011312	CTA	2	6	746845	746850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3547	NC_011312	TTAA	2	8	746857	746864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_011312	AAT	2	6	749659	749664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_011312	ATC	2	6	751367	751372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3550	NC_011312	ATT	2	6	751424	751429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_011312	AATTA	2	10	751458	751467	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_011312	TTA	2	6	751491	751496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_011312	ATT	2	6	751550	751555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_011312	TTA	2	6	751602	751607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_011312	GATA	2	8	751679	751686	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_011312	TAC	2	6	751690	751695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3557	NC_011312	GAGT	2	8	751739	751746	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_011312	GCA	2	6	751797	751802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3559	NC_011312	TCA	2	6	751820	751825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3560	NC_011312	TA	3	6	751960	751965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_011312	ATGT	3	12	751975	751986	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_011312	GAT	2	6	752028	752033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_011312	A	7	7	752172	752178	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_011312	TGT	2	6	752192	752197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_011312	A	6	6	752359	752364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_011312	A	6	6	752379	752384	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_011312	ATTT	2	8	752608	752615	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_011312	TGT	2	6	752616	752621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_011312	TTA	2	6	752627	752632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_011312	TCA	2	6	752710	752715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3571	NC_011312	ATT	2	6	752743	752748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_011312	AAT	2	6	753814	753819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_011312	TTCA	2	8	753851	753858	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3574	NC_011312	TCAA	2	8	753866	753873	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3575	NC_011312	ATC	2	6	753874	753879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3577	NC_011312	ATT	2	6	753927	753932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_011312	TAAT	2	8	753986	753993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_011312	AAAT	2	8	754008	754015	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_011312	CAT	2	6	754025	754030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3581	NC_011312	AGA	2	6	754051	754056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_011312	GAAAA	2	10	754126	754135	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_011312	TA	3	6	754167	754172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_011312	GTC	2	6	754479	754484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3586	NC_011312	ATTAA	2	10	754491	754500	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3589	NC_011312	GA	3	6	754544	754549	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3590	NC_011312	GA	4	8	754554	754561	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_011312	T	6	6	754588	754593	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3592	NC_011312	A	6	6	754607	754612	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_011312	TTTA	2	8	754640	754647	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_011312	TAAA	2	8	754671	754678	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3597	NC_011312	GTA	2	6	756327	756332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_011312	AAG	2	6	760849	760854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_011312	AGA	2	6	760859	760864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_011312	GAA	2	6	760871	760876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_011312	TTA	2	6	761056	761061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_011312	TAT	2	6	761066	761071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_011312	GTT	2	6	761073	761078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_011312	CA	3	6	761101	761106	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3605	NC_011312	TGA	2	6	761130	761135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_011312	TAAA	2	8	761136	761143	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_011312	AT	3	6	766824	766829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_011312	TGA	2	6	766831	766836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_011312	ATT	2	6	766850	766855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_011312	TGC	2	6	766894	766899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3612	NC_011312	TA	3	6	766958	766963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_011312	TAA	2	6	766977	766982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_011312	AGT	2	6	768371	768376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_011312	TAA	2	6	768380	768385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_011312	AAG	2	6	768394	768399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_011312	CTA	2	6	768405	768410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3618	NC_011312	TGT	2	6	768434	768439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_011312	TA	3	6	769839	769844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_011312	TGT	2	6	769851	769856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_011312	ATT	2	6	769895	769900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_011312	TAAT	2	8	769930	769937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_011312	TAAT	2	8	770005	770012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_011312	AACG	2	8	770031	770038	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3625	NC_011312	TTAA	2	8	770042	770049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_011312	A	8	8	770128	770135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3627	NC_011312	TAA	2	6	770224	770229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3628	NC_011312	TAG	2	6	770249	770254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3631	NC_011312	GTG	2	6	770371	770376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3632	NC_011312	TAAA	2	8	770392	770399	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3633	NC_011312	ACC	2	6	770477	770482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3634	NC_011312	TTCT	2	8	770591	770598	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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3914	NC_011312	T	6	6	852740	852745	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3947	NC_011312	AGA	2	6	854761	854766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3975	NC_011312	TAC	2	6	861781	861786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3985	NC_011312	GATG	2	8	862174	862181	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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